行業(yè)動(dòng)態(tài)
m6A修飾是最常見(jiàn)的RNA修飾之一,廣泛存在于哺乳動(dòng)物細(xì)胞中。它被認(rèn)為是共轉(zhuǎn)錄地(與轉(zhuǎn)錄同步)添加到前體mRNA上的,并在RNA代謝的多個(gè)方面(如剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯等)發(fā)揮重要作用。然而,關(guān)于m6A修飾如何影響這些RNA代謝過(guò)程的因果關(guān)系,仍然存在很多不確定性,甚至一些研究可能過(guò)于簡(jiǎn)化或誤導(dǎo)了m6A的實(shí)際功能。
圖源: Mol Cell(Mol Cell 2024),DOI: 10.1016/j.molcel.2024.07.017
為了解決這一問(wèn)題,研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了4sU耦合的m6A水平和異構(gòu)體表征測(cè)序(4sU-m6A-LAIC-seq)和4sU-GLORI技術(shù)。這些新方法能夠分別在轉(zhuǎn)錄本和單堿基水平上,量化新合成和穩(wěn)態(tài)RNA的m6A水平。這一技術(shù)突破使得研究人員能夠更加精確地分析m6A修飾與可變RNA 多聚腺苷酸 化之間的關(guān)系。
出人意料的是,研究結(jié)果顯示,許多m6A的添加事件是在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生的,特別是在那些m6A水平較高的轉(zhuǎn)錄本上。這一發(fā)現(xiàn)挑戰(zhàn)了m6A只能在轉(zhuǎn)錄期間添加的傳統(tǒng)觀念。此外,研究還發(fā)現(xiàn),較短的3' UTR異構(gòu)體通常具有更高的m6A水平,而這些異構(gòu)體可能是由于較長(zhǎng)的3' UTR異構(gòu)體在核內(nèi)停留時(shí)間較長(zhǎng)而經(jīng)歷了順序多聚腺苷酸化過(guò)程的結(jié)果。
這些發(fā)現(xiàn)表明,m6A修飾不僅僅是一個(gè)簡(jiǎn)單的共轉(zhuǎn)錄過(guò)程,還可以在轉(zhuǎn)錄后與其他關(guān)鍵的RNA代謝過(guò)程緊密耦合,從而在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中建立和動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)。
這一研究為RNA修飾領(lǐng)域提供了新的見(jiàn)解,表明m6A修飾具有更為復(fù)雜和動(dòng)態(tài)的調(diào)控機(jī)制。這一發(fā)現(xiàn)可能會(huì)推動(dòng)科學(xué)家們重新審視之前關(guān)于m6A功能的研究,并探索其在各種生理和病理過(guò)程中所扮演的多樣化角色。
未來(lái)的研究可能會(huì)進(jìn)一步探討m6A修飾與其他RNA修飾的交互作用,以及這些修飾如何共同影響基因表達(dá)和細(xì)胞功能。這不僅有助于加深我們對(duì)RNA生物學(xué)的理解,也可能為開(kāi)發(fā)新的治療策略提供新的靶點(diǎn)。
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